Juhtimisstruktuuri muutusega loodetakse vältida biosfääri programmiala tegevuse soiku jäämist.
Uues biosfääri programmdokumendis on sõnastatud neli tähtsamat sammu programmiala hoidmisel ja edendamisel: tõsta teadlikkust ja nähtavust, tugevdada hariduse ja teaduse osakaalu programmiala tegevustes, toetada kestlikke lahendusi majanduses ning kaasata juhtimisse rohkem kohalikku kompetentsi. Uues juhtimismudelis on kandev roll nihkunud keskkonnaameti ehk riigi käest kohalikesse toimekeskustesse Hiiumaal ja Saaremaal, mille tegevust toetab programmi saadikute võrgustik kõigil saartel, sealhulgas Muhus, Vormsil, Ruhnus ja Kihnus. Just juhtimise heitlikkust ja ühest asutusest teise liigutamist peab Toomas Kokovkin, üks biosfääri programmiala eestvedajatest selle algusest saadik, üheks võimalikuks komistuskiviks, miks biosfäärialaga seotud tegevus võis vahepeal tähelepanuta jääda.
